Akcja gry rozgrywa się kilka lat po wydarzeniach z Risen. Szał niszczycielskich tytanów spustoszył świat i doprowadził ludzkość na skraj zagłady. Z morskich głębin wyłoniły się potworne stworzenia, których ataki całkowicie sparaliżowały żeglugę. Bohater, obecnie członek Inkwizycji, zostaje wysłany, by odkryć, jak powstrzymać chaos wywołany przez te istoty z otchłani. Jego misja rozpoczyna się od pogłosek, że piraci odwiedzający południowe wyspy są jedynymi, którzy wiedzą, jak raz na zawsze pozbyć się potworów i zakończyć ich terror. Z zupełnie nowym, pirackim motywem przewodnim, Risen 2: Dark Waters łączy ukochane mechaniki klasycznego RPG z oryginalnego Risen ze świeżym tematem i scenerią osadzoną na ogromnej różnorodności wysp. Osadzona w mrocznym i surowym uniwersum, trzecioosobowa gra fabularna Risen 2: Dark Waters zachowuje najbardziej wciągające cechy oryginału, oferując wiele sposobów na pokonanie każdego wyzwania, co pozwala graczom kształtować świat gry na podstawie własnych decyzji. Wybory te odblokowują nowe ścieżki, funkcje i dodatkowe umiejętności dla postaci. Dzięki wysoce interaktywnemu środowisku oraz pełnemu cyklowi dnia i nocy wpływającemu na niezliczone aspekty świata gry, Risen 2 oferuje najbardziej wciągający świat RPG, jaki dotychczas powstał.